Des déchets de grandes dimensions, issus d'installations nucléaires, sont également acheminés au CSFMA. En particulier, le Centre accueillera 55 couvercles de cuve de réacteurs des centrales nucléaires jusqu'en 2014. Livrés au rythme d'environ 6 par an, ces objets de 5,5 mètres de diamètre et de 120 tonnes sont stockés dans des ouvrages aux dimensions spécialement adaptées. A fin 2009, 30 couvercles de ce type étaient déjà stockés.

