La quasi-totalité des colis livrés sur le CSTFA est acheminée par la route. Le choix du mode de transport (route, rail, …) est laissé à l'appréciation des producteurs. Compte tenu de la nature des déchets de très faible activité, l'enveloppe (fûts, big bags…) dans laquelle ils peuvent être placés n'a pas vocation à confiner la radioactivité. Elle permet essentiellement de faciliter la manipulation et le stockage des déchets, tout en protégeant les opérateurs.
Dès l'arrivée des conteneurs de déchets au CSTFA, un contrôle administratif est effectué. Il s'agit de vérifier le dossier d'expédition composé de plusieurs pièces. Il peut mentionner certaines consignes de sécurité, de manutention ou de stockage par exemple.
Les conteneurs sont ensuite acheminés vers le bâtiment logistique dans lequel sont réalisés :
- des contrôles visuels (présence des étiquettes et vérification de l'état apparent du conteneur),
- des contrôles radiologiques (mesure de l'intensité du rayonnement au contact et à 2 mètres des parois du véhicule, vérification de la non contamination surfacique des parois des conteneurs ou des colis).

